สุสานโบราณจำนวนมากถูกสร้างขึ้นในญี่ปุ่นตอนช่วงครึ่งหลังของศตวรรษที่ 3 ไปจนถึงศตรรษที่ 4 ในยุคนั้น ญี่ปุ่นยังไม่ได้รวมตัวกันเป็นประเทศเดียว แต่เป็นยุคที่เหล่าผู้มีอำนาจที่เรียกว่า "ตระกูลใหญ่"ของแต่ล่ะพื้นที่ได้ต่อสู้เพื่อแย่งชิงอำนาจกันอยู่ เหล่าตระกูลใหญ่ได้สร้างสุสานโบราณขนาดใหญ่ขึ้นเพื่อแสดงถึงพลังอำนาจของตัวเอง
จากนั้นไม่นาน ประเพณีในการทำศพก็ได้เปลี่ยนจากการฝังเป็นการเผา จึงทำให้สุสานโบราณค่อย ๆ
หายไปในช่วงศตวรรษที่ 7 ในช่วงศตวรรษที่ 3 ถึง 6 ซึ่งเป็นยุคที่มีการสร้างสุสานโบราณจำนวนมาก นี้เรียกว่า "ยุคสุสานโบราณ"

ที่สุสานโบราณมีการฝังสิ่งของลงไปเป็นจำนวนมาก ของที่มักนำไปฝังร่วมกับศพนั้นได้แก่ ของจำพวกอาวุธใช้ในการรบเช่น กระจกทองเหลือง, ดาบ, ชุดเกราะ และของจำพวกเครื่องดินเผาเช่น เครื่องประดับต่าง ๆ
นอกจากนี้ยังมีการใส่ฮานิวะ (เครื่องดินเผาที่ใช้สำหรับพิธีฝังศพ) รูปคนหรือม้าและเครื่องเคลือบทรงกระบอกลงไปอีกด้วย ยิ่งสิ่งของที่ฝังร่วมกับศพมีจำนวนมากเท่าไร ก็จะถูกมองว่าเป็นผู้ที่มีอำนาจมากเท่านั้น

สุสานโบราณที่ใหญ่ที่สุดในญี่ปุ่นคือ "สุสานโบราณไดเซ็นเรียว (สุสานของจักรพรรดินินโตคุ)" ในเมืองซาไก
เขตโอซาก้า ซึ่งรวมบริเวณที่เป็นคลองแล้วจะมีพื้นทั้งหมด 470,000 ตารางเมตร
สุสานโบราณที่มีขนาดใหญ่เป็นอันดับ 2 และ 3 ของญี่ปุ่น ก็อยู่ในเขตโอซาก้าเช่นเดียวกัน ทำให้เข้าใจได้ว่า ในสมัยก่อน ภูมิภาคคันไซเป็นบริเวณที่มีตระกูลใหญ่ที่ทรงอำนาจอยู่เป็นจำนวนมาก

รูปทรงที่มีชื่อเสียงของสุสานโบราณคือ "เซ็นโบโคเอ็นฟุน" ซึ่งเป็นรูปทรงที่คล้ายกับทรงรูกุญแจ
“สุสานโบราณไดเซ็นเรียว” (สุสานของจักรพรรดินินโตคุ) ที่เป็นสุสานโบราณที่ใหญ่ที่สุดของญี่ปุ่น ก็เป็นสุสานโบราณที่มีรูปทรงดังกล่าวเช่นกัน
นอกจากนี้ ยังมีสุสานโบราณรูปทรงอื่น ๆ อยู่อีก เช่น "เอ็นฟุน", “โฮฟุน", “ฮักกะกุฟุน", หรือ “ทรงแปดเหลี่ยม" เป็นต้น

กล่าวกันว่าสุสานโบราณไดเซ็นเรียว สุสานโบราณที่ใหญ่ที่สุดในญี่ปุ่นนั้นใช้เวลากว่า 16 ปีในการก่อสร้าง
โดยใช้แรงงานคน 2,000 คน ให้ทำงานทุกวันวันล่ะ 8 ชั่วโมง ในสมัยนั้นใช้เครื่องมือขุดที่ทำจากไม้หรือเหล็กในการก่อสร้าง กล่าวกันว่าค่าใช้จ่ายในการก่อสร้างนั้น คิดเป็นค่าเงินเยนในปัจจุบันแล้ว จะเป็นจำนวนเงินกว่าแปดหมื่นล้านเยน

จังหวัดเฮียวโงะเป็นจังหวัดที่มีสุสานโบราณมากที่สุดในญี่ปุ่นนั้น มีสุสานโบราณอยู่กว่า 16,557 แห่ง
รองลงมาคือจังหวัดจิบะ, จังหวัดทตโตริ, จังหวัดฟุคุโอกะ, และเมืองเกียวโต รวมทั้งประเทศแล้วมี
สุสานโบราณกว่า 161,1560 แห่งหลงเหลืออยู่