ในกรณีที่จะเรียกแท็กซี่ในเมือง แท็กซี่คันที่มีลูกค้าอยู่ก่อนแล้วนั้นต่อให้โบกมือเรียกแท็กซี่ก็จะไม่หยุดให้ วิธีการมองแยกรถว่าว่างหรือไม่ว่างคือ
ในเวลากลางวันจะเป็นรถที่แสดงสัญญาณไฟสีแดงตรงกระจกหน้าฝั่งที่นั่งข้างคนขับและในเวลากลางคืนให้สังเกตโดยนอกจากข้างหน้าข้างคนขับแล้วถ้ามีแสงไฟอยู่บนหลังคารถก็ถือว่าเป็นรถว่าง
เพื่อที่จะให้คนขับรู้ตัวได้ง่าย ควรจะยกมือขึ้นเรียกให้เร็วก่อนที่รถมาถึง

วิธีการขึ้นแท็กซี่นั้นแบ่งออกเป็น 2 ประเภทใหญ่ ๆ คือ
การขึ้นแท็กซี่ตรงป้ายที่เขียนว่าเป็นจุดขึ้นรถแท็กซี่
และการยกมือเรียกหยุดแท็กซี่ขณะที่แท็กซี่กำลังวิ่งอยู่
จุดขึ้นแท็กซี่ส่วนมากจะอยู่แถว ๆ วงเวียนหน้าสถานีรถไฟ ห้างและทางเข้าของแหล่งช้อปปิ้ง

แท็กซี่ของญี่ปุ่นนั้นส่วนมากจะเป็นรถที่ประตูที่นั่งด้านหลังจะเปิดโดยอัตโนมัติ ถ้าแสดงให้เห็นว่าต้องการจะขึ้นแท็กซี่ คนขับจะเปิดประตูให้เองโดยอัตโนมัติ ในตอนนี้ จำเป็นต้องระวังไม่ให้ประตูชนด้วย กรณีที่ขึ้นที่นั่งฝั่งข้างคนขับจะต้องเปิดประตูด้วยตัวเอง ในกรณีที่มีสัมภาระชิ้นใหญ่
ต้องขอให้เปิดกระโปรงหลังรถให้แล้วจึงขนสัมภาระใส่
แท็กซี่โดยทั่วไปสามารถนั่งที่นั่งข้างหลังได้ 3 คนและนั่งที่นั่งข้างคนขับ 1 คน รวมเป็น 4 คน

หากขึ้นแท็กซี่แล้วสิ่งแรกที่ต้องทำคือบอกสถานที่เป้าหมาย คนขับรถเเท็กซี่ชาวญี่ปุ่นที่พูดภาษาอังกฤษไม่ได้นั้นมีจำนวนมาก
เพื่อเป็นเลี่ยงปัญหาดังกล่าว การพกสมุดแนะนำท่องเที่ยวหรือพกกระดาษที่เขียนชื่อสถานที่เป้าหมายด้วยอักษรโรมันจะดีกว่า
และถ้าหากคนขับถามว่า"โดนนะ มิจิจุนเดะ อิคิไตเดสุคะ?(จะไปเส้นทางไหนครับ?)" ถ้าไม่มีเส้นทางเป็นพิเศษก็ให้บอกว่า
"โอมาคาเซชิมัส(ให้เป็นหน้าที่คุณเลยครับ)" ก็ได้

รถแท็กซี่ญี่ปุ่นในปัจจุบันเป็นรถปลอดบุหรี่จำนวนมาก ดังนั้นขอให้งดสูบบุหรี่ภายในรถ ต่อไปคือเรื่องอาหารและเครื่องดื่ม
ให้งดโดยควรคำนึงถึงลูกค้าคนอื่นด้วย ไม่ว่ายังไงก็ควรจะขออนุญาตคนขับเอาไว้ และควรระวังเรื่องเครื่องดื่มไม่ควรทำเลอะเบาะรถด้วย

ถ้าถึงสถานที่เป้าหมายแล้วก็จะทำการชำระเงิน ค่าแท็กซี่นั้นจะแสดงอยู่ข้าง ๆ กับที่นั่งของคนขับรถ ในกลางคืนควรจะระวังด้วยเพราะมีกรณีที่มีค่าใช้พิเศษช่วงกลางดึกด้วย และถึงจะมีแท็กซี่ที่สามารถจ่ายด้วยบัตรเครดิตได้อยู่มาก แต่ก็ยังมีแท็กซี่ที่ใช้บัตรเครดิตจ่ายไม่ได้อยู่ กรณีที่ต้องการจะจ่ายด้วยบัตรเครดิตควรจะยืนยันให้แน่ชัดก่อนที่จะขึ้นรถ
นอกจากนี้ เนื่องจากไม่มีธรรมเนียมในการให้ทิปจึงไม่จำเป็นต้องจ่าย