เรือเฟอร์รี่ของญี่ปุ่นมีประมาณ 200 เส้นทางการเดินเรือ ตั้งแต่การเดินเรือระยะทางสั้น
จนถึงแบบระยะทางไกลมากกว่า 300 กิโลเมตรขึ้นไป
ปัจจุบันมีเส้นทางเดินเรือไปยังเกาหลี รัสเซีย และจีน เป็นต้น
เรือเฟอร์รี่ของญี่ปุ่นมีความสะดวกในการใช้เดินทางระยะไกล
หรือการไปท่องเที่ยวยังเกาะที่ห่างไกลออกไป
ซึ่งเรือเฟอร์รี่ระยะทางกลางจนถึงไกลส่วนใหญ่ จะมีห้องพักผู้โดยสารเตรียมไว้คอยบริการ
ประเภทของห้องมีหลากหลาย เช่น ห้องวีไอพีอย่างห้องสวีท
ห้องส่วนตัวแบบห้องโดยสารเรือชั้นหนึ่ง และห้องขนาดใหญ่ที่มีเตียงสองชั้น เป็นต้น

ค่าโดยสารจะแตกต่างกันไปตามบริษัทการเดินเรือ ความใกล้ไกลของระยะทาง ช่วงเวลา
และประเภทของห้องพักผู้โดยสาร เป็นต้น จึงควรตรวจสอบที่โฮมเพจของเรือเฟอร์รี่ก่อนเดินทาง
เมื่อจ่ายค่าบริการสำหรับผู้ใหญ่ 1 ท่านแล้ว
เด็กทารกและเด็กเล็ก (เด็กที่ยังไม่เข้าเรียน) 1-2 ท่าน อาจจะไม่ต้องเสียค่าบริการ
นอกจากนี้ยังมีค่าบริการเสริม สำหรับการบรรทุกรถยนต์
หรือจักรยานยนต์ขึ้นเรือเฟอร์รี่แยกต่างหาก

เรือนแพเป็นหนึ่งในวัฒนธรรมดั้งเดิมของญี่ปุ่น
ที่เพลิดเพลินกับการทานอาหารและดื่มเหล้าล่องไปตามแม่น้ำ
เรือนแพสร้างขึ้นในสมัยศตวรรษที่ 17
แต่ในปัจจุบันก็ยังคงมีอยู่ ซึ่งนำมาใช้เพื่อชมทิวทัศน์เลียบแม่น้ำและดอกไม้ไฟ
เรือนแพบางลำมีการติดตั้งเครื่องคาราโอเกะไว้สำหรับงานเลี้ยงด้วย
บรรจุคนได้ประมาณตั้งแต่ 20 คนจนถึงเรือนแพขนาดใหญ่ที่บรรจุคนได้ประมาณ 100 คน

มีความแตกต่างกันบ้าง แต่โดยทั่วไปจะมีราคาตั้งแต่มากกว่า 5,000 JPY ขึ้นไป
มีทั้งแบบ 40,000-50,000 JPY ที่รวมอาหารและกิจกรรมตามฤดูกาลไว้ด้วย
จึงควรตรวจสอบค่าบริการก่อนล่วงหน้า

หากจะท่องเที่ยวญี่ปุ่น ก็มีเรือสำราญระยะเวลาสั้นที่ใช้เวลาตั้งแต่ 1 คืน-1 สัปดาห์ด้วย
เสน่ห์อยู่ตรงที่ไม่ใช่เพียงแค่การล่องเรือเที่ยวชมแหล่งท่องเที่ยวในญี่ปุ่นเท่านั้น
แต่ยังสามารถพักผ่อน และรับบริการพิเศษเฉพาะของเรือสำราญ
เช่น อาหารการกิน และการแสดงเต้น เป็นต้น
โดยเฉพาะหากเป็นเรือสำราญของบริษัทญี่ปุ่น
หลายแห่งมีการเตรียมเมนูที่สามารถเพลิดเพลินกับอาหารของญี่ปุ่นได้ด้วย

หากจะท่องเที่ยวญี่ปุ่น ก็มีเรือสำราญระยะเวลาสั้นที่ใช้เวลาตั้งแต่ 1 คืน-1 สัปดาห์ด้วย
เสน่ห์อยู่ตรงที่ไม่ใช่เพียงแค่การล่องเรือเที่ยวชมแหล่งท่องเที่ยวในญี่ปุ่นเท่านั้น
แต่ยังสามารถพักผ่อน และรับบริการพิเศษเฉพาะของเรือสำราญ
เช่น อาหารการกิน และการแสดงเต้น เป็นต้น
โดยเฉพาะหากเป็นเรือสำราญของบริษัทญี่ปุ่น
หลายแห่งมีการเตรียมเมนูที่สามารถเพลิดเพลินกับอาหารของญี่ปุ่นได้ด้วย

บางครั้งเรือเฟอร์รี่ระยะทางสั้นจะไม่จำเป็นต้องจอง แต่ให้ซื้อตั๋ววันจริงที่สถานที่จริงได้เลย
เนื่องจากเรือนแพ และเรือสำราญระยะเวลาสั้น จะมีอาหารรวมอยู่ด้วย จึงจำเป็นต้องจองล่วงหน้า
บางครั้งสามารถจองวันจริงได้เลย แต่ในวันหยุดสุดสัปดาห์ที่มีผู้ใช้บริการมากอาจมีการจองเต็มได้
โดยทั่วไปแล้ว ทั้งเรือเฟอร์รี่ เรือนแพ และเรือสำราญระยะเวลาสั้น
สามารถจองผ่านโทรศัพท์หรืออินเทอร์เน็ตได้
บางแห่งจะมีเตรียมป้ายสัญลักษณ์ภาษาอังกฤษ หรือนำเที่ยวเป็นภาษาอังกฤษด้วย
นอกจากนี้ยังสามารถจองผ่านบริษัทตัวแทนท่องเที่ยวได้อีกด้วย