일본인이 자연 속에서 흔히 즐기는 스포츠로는 하이킹과 등산을 꼽을 수 있다. 특히 고령자 중에선, 등산을 취미로 삼은 사람이 매우 많다. 고치 현에 자리한 시만토 강은 물이 맑기로 유명하여 카누 등의 스포츠가 널리 성행하고 있다. 다양한 경주도 인기가 높아 나가노 현의 야쓰가타케를 비롯한 각지의 산에서는 자전거를 이용한 힐 클라임, 산길을 달리는 트레일 러닝, 100km 이상의 거리를 달리는 울트라마라톤 등의 경주가 펼쳐진다.

일본 알프스는 혼슈(일본 열도 중 가장 큰 섬)에 자리한 고산으로, 이러한 산을 종주하는 문화도 있으며, 유명한 산에는 산장이 있어 숙박도 가능하다. 도쿄 근교에는 미슐랭 가이드에서 별 3개를 받은 다카오 산(사진)이 등산의 명소로 유명하며, 케이블카도 이용할 수 있어 등산 초보자라도 쉽게 오를 수 있다. 후지 산을 비롯해 험준한 산들은 등산 시기를 잘못 맞추면 목숨을 잃을 위험이 있다. 등산복, 신발 등의 장비를 제대로 갖추고 적절한 시기를 계획하여 등산에 나서자.

일본 각지에는 다양한 하천이 있어 기온이 올라가는 여름철을 중심으로 카누나 카약 등의 배틀 스포츠, 고무보트를 타고 강을 내려가는 래프팅 등을 즐길 수 있다. 강에서 물놀이를 즐길 수 있는 지역으로는 도쿄 도의 오쿠타마, 사이타마 현의 나가토로, 군마 현의 미나카미, 도치기 현의 기누가와 등이 인기가 높다.

기구나 패러글라이딩를 비롯한 항공 스포츠도 즐기곤 한다. 도쿄 근교에서 항공 스포츠를 즐길 수 있는 장소로는 도치기 현의 와타라세나 나가노 현의 하쿠바가 있다. 특이한 스포츠로는 동굴이나 종유굴을 탐험하는 케이빙이 있으며, 오쿠타마 등에서 체험할 수 있다. 그 밖에 야마나시 현의 야쓰가타케 등 목장이 있는 곳에서는 말을 타고 트레킹을 즐길 수 있다. 지역에 따라 독자적인 네이처 스포츠가 있다.

여름철에는 방충제를 상비해야 하며 되도록 피부를 노출시키지 않는 옷차림이 좋다. 또한, 열사병을 예방하기 위해 모자를 쓰는 것도 필수다. 일본에서 등산을 할 때는 기본적으로 텐트장이라고 불리는 야영지 외의 지역에는 텐트를 설치하면 안 된다. 화장실은 산장의 화장실을 유료로 사용하는 등 세세한 규칙이 있으므로 다른 등산객을 따라서 이용하자. 만일 조난을 당했을 경우, 민간 구조를 받으면 고액의 비용이 발생하므로 미리 보험에 가입해 놓는 것을 추천한다.