Sama seperti musim luruh, musim bunga adalah musim yang paling selesa dan ideal sepanjang tahun. Selain mengingatkan tentang kehidupan, "Hanami Sakura" juga dapat dinikmati ketika musim ini yang mana ianya merupakan tradisi bermusim di Jepun. "Hanami Sakura" bermaksud aktiviti berkelah di bawah pokok sakura bersama keluarga atau rakan-rakan, di mana mereka menjamu selera serta berpesta sambil menikmati keindahan bunga Sakura. Di Tokyo, masa terbaik untuk Hanami Sakura adalah pada akhir bulan March hingga awal bulan April.

Pada musim ini perubahan suhu agak drastik. Pada musim ini terdapat hari yang panas, tetapi disebabkan corak tekanan udara yang hampir sama dengan musim sejuk, suhu juga dapat menurun secara mendadak dan cuaca akan menjadi sejuk keesokan harinya.

Di Jepun, "Tsuyu" iaitu musim hujan akan bermula pada penghujung bulan Mei dan berterusan sehingga pertengahan bulan Julai. Suhu dan kelembapan udara akan meningkat ketika "Tsuyu", menyebabkan cuaca panas lembap.

Kawasan kepulauan selatan Jepun akan dilanda "Tsuyu" kira-kira sebulan sebelum ianya bergerak ke arah utara Jepun. Tetapi di wilayah Hokkaido tidak akan mengalami "tsuyu". Apabila tamat "tsuyu", musim panas Jepun akan bermula.

Berdasarkan laporan Jabatan Meteorologi Jepun pada tahun 2016, suhu purata musim panas di Jepun adalah 27.6 darjah Celsius, tetapi kita akan merasakan ianya lebih panas daripada itu kerana kelembapan musim panas di Jepun adalah sangat tinggi. Terdapat pelbagai acara yang dilakukan pada musim panas; contohnya pesta "Natsu Matsuri" (pesta musim panas) dan pesta "Hanabi" (pesta bunga api). Pesta-pesta ini akan diadakan sepanjang bulan Julai dan Ogos di seluruh Jepun. Kita boleh melihat masyarakat Jepun berarak sambil mengangkat Omikoshi (tokong kecil) dan bunga-api dilepaskan pada waktu malam.

Taufan biasanya akan tiba sekitar bulan Ogos hingga September. Jika anda berada di kawasan laluan taufan, aktiviti luar mungkin tidak dapat dilakukan antara 1 hingga 2 hari disebabkan angin dan hujan yang kuat. Perkhidmatan pengangkutan awam juga mungkin akan tergendala.

Sama seperti musim bunga, musim luruh juga adalah musim yang selesa dan ideal. Suhu akan menurun dan kelembapan udara juga akan mengurang, menjadikan ia musim yang sesuai untuk pelancong. Hari-hari yang bercuaca baik akan berterusan dan musim daun luruh juga akan tiba. Sama seperti aktiviti "Hanami", "Kouyou" iaitu aktiviti melihat daun luruh akan menarik pelancong ke Jepun, terutamanya di Kyoto dan Nara.

Di Tokyo, daun-daun pokok akan bertukar menjadi warna merah dan kuning pada bulan November, menghasilkan pemandangan cantik di bandar dan di gunung. Terdapat pelbagai pesta juga diadakan ketika musim ini.

Suhu di Jepun akan menurun secara drastik pada bulan Disember dan cuaca akan menjadi sangat sejuk. Suhu boleh mencecah sehingga 0 darjah selsius dan di kawasan utara seperti Hokkaido, salji tebal akan meliputi seluruh bandar. Salji yang tertimbun boleh mencecah sehingga beberapa meter tingginya. Namun begitu, kawasan yang menghadap Lautan Pasifik tidak akan bersalji dan hari cerah bercuaca sejuk akan berterusan

31 Disember dipanggil Hari "Omisoka" di Jepun. Pada hari ini, orang Jepun mempunyai budaya memakan mee soba pada waktu tarikh bertukar ke tahun baru (tengah malam). Orang Jepun akan menyambut tahun baru sehingga 7 Januari. Tempoh 7 hari ini dipanggil "Oshogatsu" dan orang Jepun akan menyambutnya dengan memakan "Osechi" dan meminum minuman beralkohol.