Sejarah museum seni Jepang berawal dari sebuah adat tua yang disebut dengan Kaicho. Kuil dan wihara kadang sesekali akan menghadirkan patung Buddha, peralatan altar, dan lukisan keagamaan yang biasanya tersembunyi dibalik pintu tertutup untuk masyarakat umum - kata Kaicho dapat diterjemahkan sebagai "membuka tirai". Museum seni seperti yang kita kenal sekarang dimulai dengan Pameran Industri Nasional Pertama yang diadakan pada tahun 1877, dan departemen seni yang didirikan bersama-sama dengan acara tersebut. Selama ledakan ekonomi ditahun 1970-an dan era 80-an, banyak museum seni yang dibangun bahkan didaerah pedesaan, dan hingga saat ini masih populer sepanjang tahun.

Taman tradisional Jepang sangat dihargai, tidak hanya di Jepang saja tapi juga diluar negeri. Banyak museum menganggap taman Jepang sebagai bentuk seni dan beberapa darinya ada didalam kawasan museum. Karya-karya seni buatan manusia yang dipadukan dengan alam memiliki daya tarik khusus sendiri dan cukup berbeda dari yang jenis seni lainnya. Taman tradisional Jepang memberikan sekilas pemandangan musiman dalam dunia miniatur mereka - indahnya hijau daun dimusim panas, cerahnya warna pada musim gugur, dan sebagainya. Salah satu tempat terbaik untuk mengalami bentuk seni ini di ibukota adalah “Museum Seni Tokyo Metropolitan Teien" yang berada di Meguro.

Beberapa museum fokus pada tema Kimono, jenis pakaian tradisional Jepang yang memiliki warna dan pola cerah yang telah menarik beberapa seniman besar sepanjang abad, termasuk seniman impresionis Claude Monet. Selain museum tradisional yang menunjukkan sejarah bentuk pakaian ini, Anda bisa menikmati berbagai museum didaerah dimana Anda bisa melihat kerajinan tekstil yang dikembangkan secara lokal.
Jepang memiliki museum seperti "Museum Kimono Ome", yang menampilkan aksesoris seperti jepit rambut hias “kanzashi” dan sisir rambut “kushi", yang keduanya adalah tambahan penting dalam menggunakan kimono.

Anime dan manga telah menjadi bagian penting dan mencolok dari budaya Jepang modern, beberapa museum yang terkenal seperti “Museum Ghibli” di Mitaka, Tokyo atau “Museum Fujiko F. Fujio" didekat kota Kawasaki, diprovinsi Kanagawa. Banyak museum mendedikasikan fungsinya untuk mengangkat bentuk kesenian tertentu, dan masing-masing memiliki tema dan konsep tersendiri. Pada saat Anda menemukan hubungan tersembunyi antara tradisi dan modernitas dengan melihat karya-karya modern disamping seni kayu-cetakan tradisional “ukiyo-e”, mungkin bisa membuat Anda melihat bentuk kesenian komik modern dengan sudut pandang yang baru.

Ada beberapa komunitas lokal yang bekerja pada proyek-proyek revitalisasi kotanya menggunakan kekuatan seni melalui kerja sama dengan pemerintah dan akademisi. Naoshima Island, sebuah komunitas terpencil di Profinsi Kagawa yang mengapung damai di Laut Pedalaman Seto, adalah contoh yang sangat terkenal dari proyek tersebut. Berbagai karya seni dipamerkan diseluruh pulau, dan mengaguminya dalam lingkungan yang indah, hangat adalah sebuah pengalaman yang benar-benar unik.

Pertama dilarang berbicara dengan keras dan menggunakan telepon seluler. Anda harus memperhatikan telepon Anda, aturlah mode getar atau “silent”. Untuk melindungi karya yang dipamerkan, minum dan makan tidak diperbolehkan.
Oleh alasan yang sama, pengambilan gambar dan filem serta menyentuh karya-karya yang dilindungi ini tidak diperbolehkan untuk semua pengunjung. Beberapa museum tidak memperbolehkan Anda untuk membuat sketsa karya seni yang ada. Bagaimanapun juga, Anda mungkin bisa mengambil gambar dari karya-karya yang dipamerkan di beberapa museum sehingga pastikan Anda tanyakan terlebih dahulu kepada staf museum, atau ikuti instruksi dan aturan yang ada. Beberapa museum kadang-kadang masih memperbolehkan Anda untuk masuk 30 menit sebelum ditutup.