Di Jepun, asal-usul manga dikatakan bermula pada abad sekitar ke-12 hingga ke-13. "Choju Giga" yang merupakan skrol bergambar yang dilukis menggunakan dakwat hitam, menggambarkan binatang-binatang yang bermain dengan berjalan menggunakan dua kaki seperti manusia (antropomorfisme) . Berbeza dengan manga moden ianya tiada “bingkai” dan juga beberapa ciri-ciri lain tetapi antropomorfisme atau watak percampuran manusia dan binatang juga telah dilihat mula diterima ramai dalam Manga moden.

Osamu Tezuka berkecimpung sebagai pelukis manga sejak 1950-an. Antara karya beliau yang terkenal adalah "Tetsuwan Atomu (Astroboy)" dan "Blackjack". Karya manga sekarang dikatakan banyak dipengaruhi oleh karya beliau. Format lukisan dan tulisan yang dibaca dari sebelah kanan dan juga teknik "pembahagian bingkai" juga dicipta oleh beliau. Malah, beliau dipanggil sebagai dewa manga berdasarkan pencapaian beliau yang telah menghasilkan lebih daripada 600 buah manga.

Kedai buku di Jepun menjual pelbagai jenis manga. Tetapi, manga yang diletak di sudut jualan manga semuanya ditulis dalam Bahasa Jepun. Manga yang dialih ke Bahasa Inggeris kebiasaannya terdapat di kedai buku yang besar, disudut yang menempatkan buku Bahasa Inggeris.

Di Jepun, selain daripada pelukis manga profesional, terdapat juga pelukis manga yang melakukannya sebagai hobi. Terdapat pelbagai manga dihasilkan setiap hari, dengan menggunakan karakter manga kesukaan mereka, ada yang mengarang sendiri plot cerita, ada juga yang mencipta sendiri karakter dan mengarang sendiri plot cerita. Terdapat juga laman web untuk mereka yang melukis ilustrasi dan manga sebagai hobi berinteraksi sesama sendiri dan juga memuat naik hasil kerja mereka. Di samping itu, ada juga mereka yang menerbitkan manga sendiri dalam bentuk buku dan menjualnya.

Doujinshi merupakan salah satu manga amatur. Doujinshi merupakan cerita yang diolah kembali dari cerita asal berdasarkan kepada karakter pada anime yang diminati ramai. Doujinshi dijual di pusat jualan dan pameran setiap hari dan di Akihabara, terdapat kedai yang hanya menjual Doujinshi. Terdapar pasaraya komik di pusat jualan dan pameran terbesar di Jepun.

Manga yang terkenal di Jepun akan diterjemah dan dijual di luar negara. “Doraemon” (karya Fujiko F Fujio), “Crayon Shin Chan” (karya Usui Yoshito) dan sebagainya yang merupakan manga kebangsaan terkenal juga di seluruh dunia, dialih Bahasa kepada Bahasa masing-masing sebelum disiarkan. Manga untuk kanak-kanak lelaki seperti “Dragon Ball” (karya Torishima Akira), “Naruto” (karya Kishimoto Masashi), dan manga untuk kanak-kanak perempuan seperti “ Sailormon pahlawan cantik” (karya Takeuchi Naoko), “Kad Captor Sakura” (karya CLAMP) juga terkenal.

Di Jepun, penerbitan manga di laman web semakin meningkat hasil dari perkembangan pesat telefon pintar. Terdapat peningkatan laman web yang membolehkan manga dibaca bukan diatas kertas. Terdapat juga laman web yang boleh dibaca secara percuma. Berbeza dengan bentuk bacaan dari kanan ke kiri, terdapat juga manga yang dibaca dari atas ke bawah bersesuaian dengan paparan di telefon pintar.