Di setiap bus kota cara naik berbeda berdasarkan rutenya. Tetapi, utamanya terdapat dua cara untuk naik.

(1) Naik dari pintu depan bus, dan turun melalui pintu belakang.
Pada metode ini, ongkos bus besarnya sama untuk semua tujuan, dan dibayarkan pada saat pertama naik bus.

(2) Naik dari pintu belakang, dan turun melalui pintu depan. Pada saat naik bus, ambillah kupon bertuliskan angka dari mesin pencetak. Ongkos perjalanan bergantung pada tujuan Anda, sehingga Anda harus melihat angka pada kupon dengan tampilan layar dalam bus, kemudian membayarkan sejumlah yang ditentukan. Masukkan uang dan kupon tadi pada kotak pembayaran yang ada di dekat kursi supir saat turun bus.

Toei bus dapat digunakan di 23 distrik Tokyo serta daerah Tama. Di 23 distrik Tokyo, penumpang naik bus dari pintu depan, kemudian masukkan ongkos bus yang telah ditetapkan pada kotak pembayaran.
Di area selain 23 distrik Tokyo, penumpang naik dari pintu belakang, dan ongkos bus akan dibayarkan pada saat akan turun.

Odakyu Bus beroperasi di wilayah barat daya Tokyo dan sebagian wilayah Kanagawa.

Keio Bus memiliki cakupan area operasi yang luas di sebelah barat Tokyo, terutama sepanjang jalur kereta Keio Line.

Keisei Bus beroperasi di wilayah timur Tokyo sampai barat laut Chiba, terutama sepanjang jalur kereta Keisei Line.

Keikyu Bus beroperasi dari wilayah sebelah selatan Shinagawa, terutama di Kanagawa.

Seibu Bus beroperasi di wilayah sebelah barat laut Tokyo sampai barat daya Saitama.

Tokyu Bus beroperasi di wilayah selatan Tokyo sampai Kanagawa, terutama sepanjang jalur kereta Tokyu Line.

Tobu Bus beroperasi di wilayah timur laut Tokyo, selatan dan barat Saitama, barat laut Chiba, dan daerah Nikko.

Untuk menggunakan bus antarkota dan eksekutif, terlebih dulu penumpang harus membeli karcis. Masing-masing karcis sesuai tujuan perjalanan dapat dipesan melalui pembelian via situs internet atau telepon. Selain kartu kredit, pembayaran juga dapat dilakukan melalui minimarket.

Terdapat perbedaan pada metode naik dan turun, cara pembayaran, pemesanan tiket dan lain lain. Pahamilah aturan dasarnya dan terapkanlah dengan bijak dan tepat.