日本人的健康意識非常高，有許多人會在意每年公司舉辦的健康檢查結果，因而限制飲食及做運動。此外，對健康有好處的食品也很容易掀起流行熱潮，電視上播放過的食品，在超市也會有缺貨的情況。在近年，一些日本至今從未出現過、被認為對減肥有很大效果的食品，如椰子油及奇亞籽、芝麻油等都受到矚目。此外，使用有機栽種的蔬菜的餐廳也很受歡迎。

日本是眾所周知的長壽之國，依據2014年的數據，男性的平均壽命為80.50歲，女性的平均壽命是86.83歲。雖然現在日本人也吃麵包及肉類等食物，但還是以米飯為主食。由於傳統的日本餐點是以魚類、納豆及豆腐等大豆製品為中心，因此有傳這種飲食生活對長壽有影響的説法。

日本自古以來就有稱為「湯治」的溫泉療法，現代也有定期前往溫泉或併設了大型浴場及按摩浴池、三溫暖等設施的健身中心的保健方法。群馬縣的草津及伊香保、神奈川縣的箱根及熱海、枥木縣的鬼怒川等，都是從江戶時代開始就廣為人知的溫泉地，可以在富有風情的景色之中享受泡湯的樂趣。

日本的溫泉，有一項禮節是在進入浴池前要將身體洗乾淨，不把毛巾等物品浸泡到溫泉裡。將長頭髮紮在一起會給人良好印象。此外，溫泉與游泳池不同，不能在裡面游泳，也不能穿衣進入浴池。有刺青的客人可能會被店家拒絕進入浴池，只有一點紋身也可能會被禁止進入浴池。進入浴池前請留心這一點。

在東洋醫學根深的日本，為了恢復疲勞會去針灸及按摩，有許多人會去整體院及脊椎按摩。針灸的保健方法是將草乾燥後的東西放在身體上燃燒，再用針刺身體，以此刺激穴道來調整身體狀況。這種保健方法也常用在體育活動所導致的身體疼痛，所以在過分使用身體的運動員中也很受歡迎。

在日本有一種常見的保健方法，那就是兒童在暑假時所舉行，稱為收音機體操的體操法。隨著收音機裡的音樂彎曲身體及跳躍，不只有兒童，有許多鄰近的居民會一起參加，是一種團體式運動。此外，也有許多人以平時步行及慢跑，作為貫徹身體健康的方法。