日本最初的百貨公司是於1904年，由現在的「三越」設立了「三越吳服店（吳服即日本的和服）」而開始的。

百貨公司的地下室，有著通稱為「百貨地下」的「百貨地下樓層」，這裡陳列著食品、甜點、調理食品和生鮮食品。特別是美輪美奐的甜點展示櫃，讓人有如置身珠寶店的錯覺。

有的百貨公司會在百貨地下或展示場舉行期間限定的特展，販賣日本各地名產、火車便當等等的商品。不用去到當地就能購買到美味名產，是十分受歡迎的活動。

在百貨公司的電梯裡，有被稱呼為「電梯小姐」的女性工作人員。最近雖然漸漸變少了，但電梯小姐主要會負責控制電梯運轉以及店內介紹引導。

百貨公司的最高樓層通常設有咖啡店和餐廳。價格多為偏高，但包括西餐、日本料理、中式料理...等等各種類型的餐廳，光是挑選餐廳也是一種樂趣。中午用餐時段因人潮眾多，可能需要排隊，敬請多加注意。

百貨公司的洗手間通常都十分潔淨。近年來，有許多百貨公司都開始更加注重洗手間的使用便利度和設計感。洗手間附近也常設置飲水機和沙發區。