說到日本最主要的航空公司、就會聯想到日本航空（JAL）與全日本空運(ANA)。日本航空不只是在日本國內、在世界上也擁有廣闊的航線網絡、以全世界第一的準時抵達率自豪、所提供穩定又優質的服務品質、受到乘客深厚的信賴。在英國的Skytrax（航空顧問公司）所訂定的航空公司評鑑中、日本航空的經濟艙以及商務艙的座艙都獲頒「最佳航空座艙」的獎項（2016年4月現在）。

全日空（ANA）佔有羽田機場大約7成的飛航數、在英國的Skytrax（航空顧問公司）所訂定的航空公司評鑑中、從2013年起連續獲得了最高5顆星的評價、作為日本的史上唯一獲得此評價的航空公司。國際線有飛往亞洲、歐洲以及美洲等地區（2016年4月現在）。

LCC是以「Low Cost Carrier」各第一個字母構成的專有名詞、以簡樸的服務項目、低價格的方式提供服務的「廉價航空公司」。包含了日本企業第一間廉價航空為「樂桃航空」、與ANA 公司100%主投資的「香草航空」、飛行日本國內線亞洲太平洋等60都市的「Jetstar」、中國的廉價航空「春秋航空」等。

廉價航空有時會有優惠活動、能夠以非常便宜的價格取得機票。JAL或ANA、如果能購提早好確定出發日期、就能夠享有事先預約的「先得」或「早割」優惠。

JAL、ANA等國內航線提供咖啡、紅茶、果汁等非酒精飲料的機上服務、廉價航空是需付費的。國際航線也是一樣、JAL、ANA是免費、廉價航空是需付費的。

除了手提包與隨身用品以外、可攜帶符合下述條件的行李上飛機。二者合計未滿10公斤的行李。經濟艙的基準尺寸是可以攜帶高度55公分以下、寬度40公分以下、深度25公分以下、並且3邊長合計不超過115公分的行李。而行李重量限制、JAL及ANA都是規定不得超過10公斤。但有可能會有變更、出發前請事先確認。

搭乘國內線時、行李規定會依各航空公司有所不同。日本航空與全日空的飛機乘客量如超過100人以上、則依照國際線的基準、但若飛機乘客量少於100人時、則高度、寬度、及深度都各比國際線再少5公分、並且3邊長合計不能超過100公分。廉價航空的Skymark與樂桃航空、可對應JAL及ANA的艙等標準、只有Jetstar Japan的規定是攜帶行李合計重量不得超過7公斤、以及高度56公分以下、寬度36公分以下、深度23公分以下。但有可能會有變更、出發前請事先確認。