日本人的健康意识非常高，有许多人会在意每年公司举办的健康检查结果，因此限制饮食及做运动。此外对健康有好处的食品也很容易掀起流行热潮，上过电视的食品在超市也会有缺货的情况。近几年一些日本至今从未出现过，被认为对减肥有很大效果的食品，如椰子油及奇亚籽、芝麻油等都受到瞩目。此外使用有机栽种的蔬菜的餐厅也很受欢迎。

日本是众所皆知的长寿之国，根据2014年的数据，男性的平均寿命为80.50岁，女性的平均寿命是86.83岁。现在的日本人虽然也吃面包及肉类等食物，但是主要还是以米饭为主食。传统的日本菜点以鱼类、纳豆及豆腐等大豆制品为主，有说法称正是这种饮食生活对长寿有作用。

日本自古以来就有称为"汤治"的温泉疗法，在现代，也有定期前往设置了大型浴场及按摩浴池、三温暖等设施的健康中心或返温泉的保健方法。群马县的草津及伊香保、神奈川县的箱根及热海、栃木县的鬼怒川等，都是从江户时代开始就广为人知的温泉地，可以在富有风情的景色之中享受泡汤的乐趣。

日本的温泉，泡温泉的礼节包括在进入浴池前要将身体洗干净，不把毛巾等物品浸泡到温泉里等。将长头发扎在一起会给人良好印象。此外，温泉与游泳池不同，不能在里面游泳，也不能穿衣进入浴池。有刺青的客人可能会被店家拒绝进入浴池，只有一点纹身也可能会被禁止进入浴池。进入浴池前请先注意这一点。

在东洋医学根深的日本，为了恢复疲劳而去按摩院、整体院针灸按摩的人很多。针灸的保健方法是将干燥后的草放在身体上燃烧，用针刺身体，以此刺激穴道来调整身体状况。这种保健方法也常用在缓解体育活动所导致的身体疼痛上，所以在过分使用身体的运动员群体中也很受欢迎。

在日本有一种常见的保健方法，那就是儿童在暑假时所举行称为收音机体操的体操法。以这种团体模式来做的随着收音机里的音乐弯曲身体及跳跃的运动，不只有儿童，许多邻近的居民也会一起参加。其他也有许多人是在平时步行及慢跑，将其作为贯彻身体健康的方法。