春天和秋天是一年中最舒服的季节。春天是万物复苏的时节，这时可以进行体现春天风情的活动——赏樱。各地的樱花景点均会举行赏樱活动。东京赏樱的最好时机是3月下旬〜4月上旬。但是这个季节有时会发生“倒春寒”的现象，前一天还是很暖和，第二天马上变得很冷。

从5月末到7月中旬，阴郁多雨的梅雨时期一直持续。气温和湿度一起上升，天气十分闷热。梅雨期间锋面从南往北移动，所以日本南部地区进入梅雨时节早一些，跨越日本列岛大约需要一个月时间，渐渐北上。其中，北海道没有梅雨季节。梅雨季节结束后，天气开始变得炎热，夏天开始到来。

根据气象厅2016年8月的数据显示，日本夏天的平均气温是27.6度。但是由于湿度高，所以身体感觉到的温度比实际高，觉得天气非常闷热。日本夏天的活动要数夏日祭和烟火大会。7月到8月期间在日本各地举行夏日祭，许多人抬着神轿游行。在海边和河边会举行烟火大会，绽放的烟花把夜空照耀得色彩斑斓，灿烂夺目。

台风在8-9月到来，所到之处狂风暴雨，有时甚至会导致交通瘫痪。

秋天和春天一样，是天气很好的时节。夏天的闷热得到缓解，湿度下降，空气变得干燥。红叶季和春天的樱花季一样，许多游客为了看红叶，到京都、奈良、日光等红叶名所观光。
在东京，11月的时候，落叶树的叶子变成红色或黄色，在山上或种有树木的街道都可以欣赏到红叶的美景。还有，很多文化活动都在这个时节展开。

到了12月，气温下降，天气变冷。12月结束之后天气越发寒冷，从1月到3月，出现气温达到零下的日子也不足为奇。北陆、东北、北海道地区出现积雪。东京都内也有过降雪量大的年份。特别是面向日本海的东海、北陆地区，积雪达数米之深。相反太平洋沿岸积雪并没有那么多，虽然天气寒冷，但却多数是晴朗的好天气。
12月31日是大除夕夜，跨年的时候有吃荞麦面的习惯。从1月1日-7日的7天被称为正月，人们吃应节料理，喝酒来祝贺新年。