去神社或寺院參拜稱為「お参り」(omairi)，參拜時為了平靜自我內心心靈，以及請求神明、佛祖允許進入神佛的領域，有一套嚴格的流程。
神社的話，首先要先穿越鳥居進入神社的占地內，只要是神社都有鳥居，要有個認知就是，穿過鳥居之後就是進入神的領域了；寺院的話要通過山門進入寺院的占地。不論是前往神社或寺院都要保持內心平靜，對於身邊周遭所有看得見的東西也好，看不見的東西也好，都要抱持著感謝的心意。

不論是神社或寺院，都會有一個洗滌參拜者身心，稱為「手水舍」的地方。「手水舍」正確的使用方式如下。
1.首先用右手取木杓舀一盆水，然後用水清洗左手。
2.接下來換左手拿杓取水，清洗右手。
3.之後，再將杓柄換至右手，將水倒進左手中，用左手的水漱口，不需要喝，可以將水吐掉。
4.再洗一次左手，用杓內的的殘水洗一下杓柄，把木杓歸還原位。

※因應預防新型冠狀病毒感染症的影響，許多地方手水舍可能會禁止使用

參拜的方式和清洗淨身的時候一樣有固定的儀式。請記得神社是二拜二拍手一拜，寺院是行合掌禮。

參拜神社
1.首先將賽錢投進賽錢箱
2.搖鈴之後行二次鞠躬禮，拍二次掌，開始祈福
3.最後行一鞠躬禮

※因應預防新型冠狀病毒感染症的影響，許多地方已取消搖鈴的使用
※依照各家神社的方式，也有「二拜四拍手一拜」等的特殊作法

參拜寺院
1.首先將賽錢投進賽錢箱
2.有鳄口的話敲一下鳄口，不需要拍掌，直接合掌於胸前祈福
3.最後行一鞠躬禮

一般大多是投5圓日幣即可。因為在日語中，5圓的發音和良緣(ご縁goen)一樣，如果沒有5圓硬幣的話，也可以投日語發音中也是和良緣有關的11日圓、25日圓、41日圓或45日圓。而日語發音和遙遠的緣分相同的10圓日幣最好避免。

關於參拜時的說明，為了讓大家比例容易理解，所以用了「祈求」的字眼，其實不論是神道還是佛教，實際上是做了祈求之外的行為。
比較接近的說法可說成，在神社是祈願今生的幸福，在寺院是祈願死後的極樂世界。在前往神社參拜時，是要洗滌過往的穢氣並表明今後新的決意，而在寺院參拜是類似向佛祖宣誓要改善自己的行為舉止。

神社最有人氣的物品是御守，御守有各式各樣的種類，分別有學業、健康、愛情等願望。顏色鮮艷的小袋狀，可別在背包、手機，也可放在車內或桌上。
在神社和寺院也有販賣「籤詩」，籤詩是會將寫著關於健康、工作、婚姻等的運勢的紙籤，折成小條狀，再從木箱把小紙條抽出、購買。在這個木箱裏有吉的籤詩的話，也有凶的籤詩，但不論吉或凶，在看完內容之後，要將籤詩打綁在神社或寺院準備的牆壁或木頭上，如此一來神明或佛祖就會保佑吉運，化解凶運。但你也可以把好的籤帶在身上當護身符，不好的籤綁在神社木頭上祈求化解。

現代日本人大多沒有信仰特定的宗教，但是可從多數人日常生活中也會前往寺院或神社參拜，看得出佛教和神道在日本人的生活與習慣中根深柢固。參拜神社或寺院，也是一種體驗日本文化的方法。