在日本，漫画起源于绘画书卷，要追溯到12～13世纪。它被称为“鸟兽戏画”，是用墨水进行描绘的画卷，描绘的是动物用双脚行走、像人类一样玩耍的样子。虽然没有“分格”，不同于现代漫画的形式，但从动物拟人化能看出其与当今漫画有着相通之处。

手冢治虫是1950年代开始活跃的漫画家，代表作是《铁臂阿童木》和《怪医黑杰克》。他是对现在的漫画形式影响最深的漫画家。从右往左的阅读顺序、 “分格划分”的技巧都是由他所创。他曾创作出600多部作品，被称为漫画之神。

日本书店出售各种各样的漫画。但是，漫画卖场里的所有漫画都是日语的。翻译成英语的漫画大多数陈列在规模较大的书店的外文书专区。

在日本，除了专业漫画家以外，有很多人把画漫画当作兴趣。他们或使用自己喜欢的漫画角色来创作故事，或使用自己原创的角色来创作故事，每天都有各种各样的漫画诞生。供喜欢画插画和漫画的人进行交流的网站上有很多投稿作品。此外，也有人将自己的漫画印刷成书，进行销售。

同人志是业余漫画的一种，是指使用人气动漫角色来创作故事的二次创作。平时会举行贩卖同人志的活动，在秋叶原或池袋还有专门贩卖同人志的店铺。日本最大规模的同人志贩卖活动是Comic Market。

日本的热门作品，在海外也被翻译成外文并进行销售。《哆啦A梦》（藤子·F·不二雄作）、《蜡笔小新》（臼井仪人作）等国民漫画在世界范围内也很受欢迎，各国语言版本的动画也在放送。另外，受欢迎的少年漫画有《龙珠》（鸟山明作）、《火影忍者》（岸本齐史作），少女漫画有《美少女战士》（武内直子作）、《魔卡少女樱》（CLAMP作）等。

在日本，随着智能手机的普及，非纸质网络漫画的网站一直在增加。其中也有免费的网站。为了适应智能手机的画面，有些漫画作出了改变，阅读顺序不是“从右往左”，而是“从上往下”。