1日元硬币由纯铝制成，是日本的硬币中尺寸最小、分量最轻的。硬币正面刻有“小树”的图案以及“一円”和“日本国”的字样。背面刻有数字“1”以及制造年份。该硬币的最大特征在于，正面的小树图案的原型是虚构的植物，简单而大方。每个1日元硬币的制作成本约为2日元。自动贩卖机和车站的自动售票机多数不收1日元硬币。

黄铜制的中间带孔的硬币。正面是发行时象征着日本主要产业——农业、水产业、工业的“稻穗”、“水”以及“齿轮”的图案。背面是“日本国”的字样以及制造年份，此外还刻有两片小叶子。在全球范围内极为罕见的带孔硬币中，日本的5日元硬币既能带来好运（因为5日元的日语发音与“缘份”的发音相同），价格又便宜，很多人用此作为礼物送人。

青铜制的硬币。正面刻有世界文化遗产“平等院凤凰堂”以及“蔓草“的图案。此外还有“日本国”和“十円”的字样。背面刻有“常绿植物”的图案、数字“10”以及制造年份。10日元硬币广泛用于自动贩卖机、交通工具和公共电话等，使用频率非常高，所以多准备点也无妨。

白铜制的中间带孔的硬币。正面是”单瓣菊花”的图案以及“日本”、“五十円”的字样。背面刻有数字“50”和制造年份。1日元硬币和50日元硬币都是通过公开征集最终决定设计样式的。

白铜铸造的硬币。正面刻有“樱花”图案以及“日本国”、“百円”的字样。背面刻着数字“100”以及制造年份。和10日元硬币一样，100日元硬币也被广泛用于自动贩卖机、交通工具和公共电话等，属于使用频率颇高的硬币。

镍和黄铜铸成的最大的硬币。正面刻有“泡桐”图案、“日本国”以及“五百円”的字样。背面刻有“竹”和“柑橘”的图案、数字“500”和制造年份。

纸币正面印有日本学者野口英世的画像，背面印有“富士山”和“樱花”。有时候自动贩卖机等设备虽然不接收大面额纸币，但是基本上还是会接收1000日元纸币。所以多拿几张1000 日元纸币还是比较放心的。

正面印有“守礼门”图案的纸币。背面印有日本国宝级的“源氏物语绘卷”的部分图案，以及画有作者紫式部肖像的“紫式部日记绘卷”。此外，在2000年发行的新版纸币中还采用了多种前所未有的最新防伪技术。不过，该面额的纸币至今依然没有成为常用货币，流通量较少。

该纸币正面印有日本作家樋口一叶的肖像。背面印有画家尾形光琳的作品《燕子花图》。

纸币正面印有教育家、兰学家（兰学：日本锁国时代通过荷兰传入的西方科学文化知识）和思想家福泽谕吉的肖像，背面印有平等院的“凤凰像”。10000 日元纸币是日本当今最大面额的纸币。